Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms