Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms