Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms