Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
RPS29P62273 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms