Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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