Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP9P55211 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP9P55211 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms