Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNTBP49356 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms