Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTAP49354 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms