Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms