Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETV4P43268 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms