Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms