Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SFTPDP35247 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms