Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL9P32969 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL9P32969 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL9P32969 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms