Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA7P31268 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms