Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms