Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HOXD10P28358 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms