Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLD1P28340 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLD1P28340 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLD1P28340 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms