Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB5P28074 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms