Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms