Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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