Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms