Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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