Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms