Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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