Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JRKO75564 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JRKO75564 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JRKO75564 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms