Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E5RI56 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E5RI56 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E5RI56 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E5RI56 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms