Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms