Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms