Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms