Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms