Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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ARL2-SNX15V9GYD0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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