Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms