Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms