Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms