Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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