Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS29Q9UBQ0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms