Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms