Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms