Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms