Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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RDH8Q9NYR8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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RDH8Q9NYR8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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RDH8Q9NYR8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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RDH8Q9NYR8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RDH8Q9NYR8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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