Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms