Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM248Q9NWD8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms