Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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