Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms