Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms