Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms