Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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