Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP4Q9H6H4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms