Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRDM12Q9H4Q4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRDM12Q9H4Q4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms