Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCD2Q9BXW9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms